目前山东的抗清义军除了鲁南的宫文彩部之外，以谢迁、马应试两部最为主要，蔡仕被派到了谢迁军中，马宝则被派到了马应试军中，原因是谢迁部面临的军事压力暂时不大，只靠胶州总兵海时行一部清军消灭谢迁并不现实，所以对谢迁部的政治指导更主要，而马应试领导的榆园军直接面对张存仁从直豫两省调集来的围剿部队，对他的军事指导更为主要。
宫文彩现在的处境比较轻松，他面对的主要是绿营沂州总兵夏承德部。这个在松锦大战的关键时刻出卖了洪承畴的人并没有得到多少重视，在兵员、粮饷、武器装备的配给上都没有被放在优先位置。宫文彩与夏承德交手数次，夏承德确定没办法迅速消灭宫文彩之后，就再也不搞大规模的战斗了，双方互相零敲碎打，相持不下，这让宫文彩有能力分出一些人手去支援其他义军。徐州附近的任应乾等部义军也接受了宫文彩的领导。
其实宫文彩有些失望，多铎指挥的清军主力没有来沂蒙山进剿他的兵马，而是直奔浙江去了，看来还是没把他放在眼里。但是也不得不承认，他的部队如果拉到山外和清军硬碰硬地干一仗，怕是坚持不了一个时辰。另一方面，清廷也要考虑作战的成本问题，虽然福建、浙江的唐鲁二王根本无法反攻到钱塘江以北地区，但是清军还是分出大量军队去攻击他们，因为对闽浙两省的攻略能以战养战，弥补军费的不足。如果钻山沟去追剿宫文彩，可没有什么金银财宝可以让清军缴获，被清军反复蹂躏的山东甚至不一定能提供足够供给多铎大军的粮食。
多铎部需要同时在三条战线上作战。第一条是鲁王朱以海费尽心力构建的钱塘江防线，这条防线以方国安、王之仁两部为核心，浙江有很多民间义军前来加入防线，可是鲁监国的官员不得不把他们一一劝走，朱以海手上现有的钱粮供给方王二部尚且不足，哪里养得起这么多义军。多铎有十足的把握，可以一战击垮这道防线，而且几乎不会付出什么代价。
第二条战线是南直隶西部三府，武昌朝廷辖下的刘汝魁、郭升、刘世俊三部和李成栋、张天禄、于永绶、高进库、李本深等部绿营对峙。双方始终没有正面大战，但是小规模冲突不断，谁也没占到什么便宜。多铎的计划是先拿下闽浙，再回头解决南直隶的问题，言下之意是有时间就解决，没时间就放着吧。多铎认为南直隶的闯军背靠大别山，依托长江和黄斌卿的水师防守，是一块难啃的骨头，如果对他们花太多精力，会影响到闽浙攻略。多铎不仅没打算对这三府派出主力，还抽走了曹存性、于永绶、田雄、张国柱、李成栋等部。因为刘芳亮去了湖广战场，刘汝魁、郭升、刘世俊没有了后援，也没有能力发动大规模的进攻。
第三条战线就是山东战场，多铎不打算投入太多精力，他认为宫文彩等人不过是癣疥之疾，由张存仁带着绿营对付就足够了。
五月十五日，多铎抵达杭州。
王之仁的水师控制钱塘江，张存仁之前在击退鲁军的攻击之后曾经尝试攻过钱塘江，结果被王之仁击退了。然而今年浙江大旱，钱塘江的水位大幅下降。多铎当机立断，命江宁提督曹存性率绿营开路，涉水过江，猛击明军左翼的方国安部。方国安当时不在军营之内，因为他的部下和黄宗羲带来的义军“世忠营”发生了冲突，方国安的部下对一个村子征粮，而黄宗羲的人比他们早到了一个时辰，双方话不投机，便打了起来。方部发挥了左良玉部的优良传统，痛击队友的时候战斗力爆表，把黄宗羲的部下打死打伤了数十人。方国安赶过去处理，把自己的人臭骂了一顿，但是抢来的粮食、财物、女人是肯定不会还的，还厚葬了己方的四个死者。黄宗羲兵微将寡，自然惹不起方国安这样的大帅，只能作罢。就在方国安带着百余名部下返回营地的路上，清军的攻击开始了，方国安正撞上了李成栋的部下阎可义。双方混杀一场，事后打扫战场时，阎可义才发现自己居然意外讨取了方国安。方国安的部队没有指挥，在清军的突袭之下迅速陷入混乱之中，他的侄子方元科刚刚把队伍组织起来，清军便蜂拥而至，方元科死于乱军之中，方部全军大溃。清军斩杀明军数千，而自身的折损仅有明军的一成，要知道，这不是八旗兵，而是前不久还和方国安部一样的绿营汉军。然而这些人降清之后拿到了更高的军饷，有了更严格的纪律约束，在主子的撑腰下还有必胜的信念，战斗力和昔日的同僚便有了天壤之别。
方国安既溃，王之仁当然不可能再支撑。王之仁的兄长是大太监王之心，当初李自成兵临北京城下，崇祯要求城内的勋贵、太监、高官捐资助饷，王之心只拿出一万两银子。而闯军攻下北京之后，王之心在刘宗敏的夹棍下交出了十五万两银子，刘宗敏不满意，一定要他交三十万两，王之心受刑不过，又拿出了价值十几万两银子的金银器皿、古玩字画，最后虽然被放了出来，但还是死于刑伤。因为有这样一个大贪官、大太监做哥哥，王之仁在南方官场上的名声素来不佳。清军渡江之际，他随大流跟着投降了，然而随后剃发令颁布，王之仁能当叛徒，可是当奴才就超过他的底线了，他又举兵反正，投入了反清运动之中，成为了鲁监国政权的核心之一。他会合了带着台州水师来增援的张名振，保护鲁王朱以海乘船逃亡。半途中，他们遭到了绿营张国柱部的截击，然而葬身大海的却是张国柱，沈廷扬的水师从背后给了张国柱致命一击。混战之中，明清两军的损失都不小，但大海毕竟是明军的主场，最终还是明军取得了胜利，张国柱中炮毙命，明军成功突围，撤退到了舟山。小小的舟山涌入了这么多军队，根本安置不下，很多士兵和家属都只能住在船上。张名振、王之仁、荆本彻、贺君尧等部明军都以劫掠为生，沈廷扬虽然不满，却也无法禁止，他没有足够的粮食去供养这么多部队，不让他们打劫就得让他们饿死。但是鲁监国政权在浙东的民心也因此被败得差不多了。王翊、黄宗羲、李长祥等人进入了四明山等地的山寨之中坚持抵抗，鲁王派右佥都御史张煌言去联络他们。王翊、李长祥两部军纪严明，不杀不掠，耕田自给，很得百姓爱戴，其他各部的军纪就参差不齐了。有的部队如黄宗羲部因为实力太弱，没法直接控制产粮区，只能靠对清统区的百姓强行摊派来维持军需，这还算是相对有底线的，有的部队则完全与土匪无异。这样的军队自然无法得到百姓的拥护，黄宗羲的山寨在他外出之际被老百姓烧掉了，只好撤到了舟山。有的山寨对剃发之民滥抢滥杀，结果导致了当地蓄发百姓与剃发百姓之间的火并械斗。
鲁监国政权中的很多人，如谢三宾、阮大铖等都投降了清军，大学士张国维等来不及撤退的人自杀，浙江的防御土崩瓦解。多铎一路势如破竹地进军，然而却在一座小城面前，被一个有名的大贪官挡住了去路。