在鹿邑县，高一功遭到了尼堪的阻击，清军总不能就这样看着高一功步步紧逼，尼堪要是一路败退回大营，他以后也不用混了。三月十日，明军包围鹿邑县，尼堪、尚可喜所部约两万人被困城内。尽管被四倍于己的敌军包围，尼堪和尚可喜却并不担忧自己的前景，有多尔衮的大军在东，他们很快就会获得援军。
不过，多尔衮倒是真的犹豫过，要不要派兵救援尼堪。高一功来势汹汹，迅速攻下了太清宫，切断了尼堪与多尔衮的联系，看来决心很大，尼堪和尚可喜恐怕不见得能支撑太久。但是如果分兵去救援尼堪，攻击亳州的兵力就弱了，恐怕短时间内就吃不下李过，而且他就算支援鹿邑，也不能派出太多的人，虽然可以保住鹿邑，却不可能把高一功的八万大军打退，这样一来，岂不是要和明军打持久战。
在南线，张能遭到了洪承畴的攻击，尽管黄斌卿、郭升、马进忠、刘汝魁等人沿江东下发动了对江南的攻击，试图牵制清军，但洪承畴还是把江宁提督曹存性的兵马调到了庐州，替下张天禄和卜从善前往凤阳参战。还是熟悉的配方，还是熟悉的味道，洪承畴把原本隶属于弘光朝廷的这些绿营兵发挥出了最大作用。当年在史可法麾下的时候，这帮人一个个贪生怕死，无论是打清军还是打顺军，都是不战而奔，可现在却可以和明军打得旗鼓相当。不管洪承畴的人品如何卑劣，他确实是明末最会打仗的文官，知道如何调动部下的积极性，给予他们怎样的奖励和惩罚，并把他们派到合适的地方。亳州战场才是最关键的，绝不能让张能赶回亳州参战，为此就算让明军打到南京城下也不要紧。操将总督陈锦的兵马以及巴山指挥的南京驻防满军是洪承畴最后的预备队，但是多尔衮并不像济尔哈朗、岳乐那样信任洪承畴，洪承畴无权指挥陈锦和巴山，要等勒克德浑到来，这两支军队才能对战场产生影响。
洪承畴最担心的是苏松提督吴胜兆部，吴胜兆曾经由于纵兵抢掠和贪污军饷被张存仁弹劾，与江宁巡抚土国宝也有很深的矛盾，对清廷的不满很深。而且他原本是明朝的倒马关副将，隶属于保定总督，曾经被孙传庭、杨文岳、侯恂、吕大器等人指挥，却没做过洪承畴的部下，他的老上级吕大器，去年也被提拔为武昌义兴朝廷的大学士，洪承畴一直怀疑他和明军有勾连。目前吴胜兆正在负责镇压太湖义军，也不见他有什么战果。洪承畴不仅不能指望他参战，还要分心去监视他，不过吴胜兆离所有的明军主力部队都很远，所以洪承畴倒也不担心他掀起什么大浪。
由于张天禄、李遇春、卜从善等部的牵制，张能难以脱身，他让皮熊守卫蒙城，朱旻如守卫寿州，自己前来亳州支援李过，但是这样一来，他手上的兵力只剩下了八千人，根本无法接近亳州。清军孔有德部已经来到亳州以南，阻击明军增援，张能尝试突破封锁，反而吃了不小的亏。
明军中甚至有人质疑，为什么一定要在这样一个不利的地方决战。但是李过很清楚，如果不在亳州堵住多尔衮，明军的处境只会更不利。一旦多尔衮越过亳州，张能就只能撤退，多尔衮将与洪承畴会师，明军的右翼完全暴露，清军沿淮河西进，基本上不会担心补给问题，明军将不得不在大别山北麓与之会战，否则清军便会直接威胁武昌、安庆、九江，那样的话，明军的处境又能好到哪里去？李过甚至做了最坏的打算，就算他和高一功在此兵败，清军也不可能完好无损，党守素、贺兰等人依然有时间在后方重新组织兵力，刘芳亮、刘希尧放弃浙江战场，返回江西，明军还依然拥有水军优势，清军是无法突破长江的。这样的话，明朝依然有半壁江山，依然还有机会。
三月十二日，亳州城墙的攻防战进入白热化，清军一批批攻上城墙，又一批批被击退。尽管战役开始才七天，李过的兵马却已经死伤了七八千人，清军不顾一切地猛攻，一定要抢在高一功赶到前消灭李过。此次作战不比以往，摄政王亲自坐镇指挥，满洲精兵泰半出征，实乃清朝国运所系，此战若败，清军恐怕想退回关外都难，故而他们的拼命程度也远胜往昔。
目前郝摇旗、孙守法、李明忠、秦翼明四人各自负责一个方向的防御，李过居中指挥，只有陈邦傅，李过不知道该怎么安排。要说全军谁对李过最恭谨，那肯定是陈邦傅。李明忠书生从军，脾气又臭又硬，否则也不会被崇祯晾了十几年没有官做，郝摇旗仗着和李过熟，更是口无遮拦，但陈邦傅却处处逢迎，此次北上，他甚至还提出想拜几乎与他同龄的高桂英为义母。李过心里一直很鄙视此人，但他是广西的实力派，又不能不加敷衍。这一次，李过不敢让他承担一路防务的重任，可让他负责动员民夫，组织后勤，他又会趁机抢掠。结果在这大敌当前，城头血战的紧急关头，陈邦傅这几千兵马居然闲下来了。
李过当然不能容忍这种情况，他在努力设法挖陈邦傅的墙脚，让他的部下梁士奕、李雅、徐彪三人各带一千军队去增援孙守法、秦翼明和李明忠。由于陈邦傅始终抗拒改编，陈部的战斗力实在堪忧，装备也非常简陋，不过总归强过民夫，放屁也添风。
此次北伐，陈邦傅原本是不想来的，但是出征与改编不同，武昌朝廷有足够的大义名分，如果他敢公然抗命，田虎和郝摇旗一定会毫不犹豫地武力解决他。现在还留在武昌朝廷这边的明朝官军将领，基本都是孙守法、焦琏这种很有抗清热情的，陈邦傅如果因为不肯出征被杀，绝对没人会同情他，因此陈邦傅只能硬着头皮上了前线。田虎的本意，是在作战过程中把陈邦傅的部队一点点吸收了。但李过担心刺激其他明朝官军出身的将领，迟迟没有下手，郝摇旗又嫌陈邦傅累赘，屡屡甩开他作战，于是陈部的改编计划就一直拖到了现在还没落实。