李来亨也知道不能再打下去了，明清两军都已经到了极限，如果非要血战到底，把清军逼得狗急跳墙，结果便难以预料了。他不怕牺牲，可也不想现在就牺牲。王永强也是沙场宿将，很清楚这一点。明军收拢混乱的队形，逐步稳住阵脚。豪格的冲击又给两军造成了不小的伤亡，但是也没能对战场局势造成多大的改变。天色已晚，明军和清军的体力也濒临耗尽，实在不能再摸黑拼命了。清军缓缓东撤，明军也退向洛河以西，商原之役就这样结束了。
李来亨部一万三千人，阵亡四千，伤者七千，身上没见血的连两千人都不到，王永强、刘弘才部一万五千人，阵亡两千，伤者八千，也只剩下了三分之一的人，主要将领中黄色俊战死，刘弘才断臂。两万四千清军，战死五千余人，伤者一万两千，也损折了巴颜、喀尔楚浑等将佐。围攻白塚镇的王永吉、秦一藩得到王永强传讯之后即刻撤退，尼堪又趁机出城追杀了一阵，再加上攻城时的损失，前后总共死伤、被俘三千多人，逃散者大约也有此数。
这一场战役可以说没有赢家。豪格部下的满洲兵约有三千人，在这一战中战死了将近五百个，伤者逾千，然而豪格既没能歼灭敌人，也没能夺下城池，他得好好考虑考虑回京之后如何交代了。同时，李来亨和王永强的兵马也丧失了作战能力，短时间内难以恢复。许多身经百战的老兵战死、残疾，这都是难以弥补的巨大损失，马匹也严重损耗。
但是对于整个陕西，乃至全中国的战局来说，这一战的意义就不同了。豪格解西安之围的计划彻底化为泡影，想必何洛会、孟乔芳等人得知这个消息之后，脸上的表情一定会十分精彩。
李来亨和王永强来到刘弘才的担架边，刘弘才勉强挤出一丝笑容，让他本就颜值堪忧的脸变得更难看了。李来亨激动地拉着他的左手：“弘才叔……”不禁有些哽咽，刘弘才笑道：“脸别这么难看，我们不是打赢了嘛！只可惜我是个废人了，将来怕是再难帮上你们了。”又看了看李来亨手臂上的绷带，“我营中有烈酒，你拿来洗洗伤口，免得溃烂。这一次死伤了这么多兄弟，但这一仗打得值，从此之后，陕西就是咱们的了，永远都是咱们的了！老掌盘泉下有知，也一定夸我们打得好！”
王永强虽然也做过农民军，但并非李自成嫡系，自然不会像刘弘才和李来亨这样时时念着李自成，他抹了抹脸上的血污，拱手行礼：“这次我的兵丢了人了，若不是二位将军率部浴血奋战，我险些坏了国家大事，王某在此赔礼了。”李来亨说：“同为国家效力，何分彼此。”刘弘才说：“经此一战，我们已经是生死之交，战场之上背靠背的兄弟，还计较这些干什么。”王永强说：“我是下定决心了，趁着这次休整的机会，一定要按照闯军的军纪重新整顿部队，再不能他妈这么乱糟糟地打仗了。”王永强之前对李来亨这个太过年轻的上司还颇有些不以为然，觉得他是靠李过养子的身份才得居高位，但是经此一战，他觉得此人的确有资格做自己的领导。因为从五岁起就在李自成军中，从小见的都是兵戈杀伐，他并没有同龄人中常见的稚嫩，自三年前独立领兵，开始敌后斗争以来，李来亨被淬炼得更加沉稳刚毅。商原一战，更证明了他的能力和气魄。王永强心中除了佩服之外，还有了一些别样的想法。刘宗敏无子，就算有，征虏大将军一职也不见得父死子继，而闯军年轻一代的将领中，无论出身还是能力，有谁胜得过李来亨呢？
由于损失太大，李来亨决定全面放弃同州、朝邑、潼关一带，把兵马拉到蒲城、富平附近休整，豪格的粮道倒是打通了，可吃粮的人却没那么多了。
李来亨的捷报传到西安，高一功原样转给刘宗敏，在孙守法和贺珍的建议下，高一功命人重新写了一个版本，连夜抄写一万份，用箭射入西安城中。
“义兴二年四月十日，王师于同州商原大破东虏，斩首两万五千零四十一级。伪肃王豪格负创弃盔而逃，都统巴颜、汗孙喀尔楚浑等毙命，缴获粮草军械、铳炮马匹无算。虏兵仓皇夜遁，逃窜山西，又于黄河之中遇风翻船，葬身鱼腹者数万，今已翦灭无遗。西安军民，皆为秦人，缘何助纣为虐，抗拒王师？虏兵暴虐，残害关中，杀我父老，夺我金帛，掠我土地，毁我文明。今虏势已微，黄龙之捣在即，孤城岂可困守。大明权将军郧阳伯高，发大兵二十万，今已光复全陕，独西安未下。体念陕西父老乱世求生不易，为虏胁迫，甚是可怜，故不轻动兵戈，以免玉石俱焚。盼尔等勿忘祖宗，勿做奴才，勿为鞑虏殉葬。有能擒何洛会者，封伯爵，擒孟乔芳者，封子爵，以下官兵反正归顺，皆既往不咎，按月给饷。倘为虎作伥，怙恶不悛，甘为汉奸走狗，破城之日一概诛戮，绝不宽宥。”
这份文书伴随着箭雨一同射入城中，同时明军还用投石机把李来亨从商原送来的首级抛入城内。虽然只有三千来颗，而且大部分都是绿营兵的脑袋，但城内的百姓和普通士兵又哪里分得清楚。西安城外竖起了一根高杆，挑着“豪格”的头盔（其实是巴颜的），两旁挂着巴颜和喀尔楚浑的首级，西安城内下了这一场人头雨，本就不稳的军心民心濒临崩溃。文书中的具体数字肯定有水分，不过清军的援军吃了大亏，有两个都统被打死这一点是毫无疑问的，城内守军大部分都是绿营，有几个肯给大清尽忠？何洛会和孟乔芳一口气斩杀了几十名“谣言惑众”的士兵和百姓，才算暂时控制住城内的局势，而明军射进来的信却只收回三千多张。他们开始怀疑身边的每一个人，看谁都像叛徒。
但是不久之后，更坏的消息来了。