清军的火炮大多对着府谷城，此时阵地上只有一些轻型火炮和火铳，并不足以阻止明军精锐的冲锋，但是他们预先布置的壕沟拒马发挥了作用，明军骑兵无法越过，只能下马步战。清军很快发现，这些人绝非普通的明军，三路兵马个个骁勇强悍，沉稳老辣。负责中路的主将土伦泰率领十几个亲兵砍开鹿角，当先突入清军阵地。
这一千两百人的突击队，是郭君镇从一万八千军队中精挑细选出来的，四百汉人，四百蒙古人，四百维吾尔人，分别由蒋国泰、扎穆素、土伦泰三人率领。郭君镇备下一千二百两黄金，约定哪一队先攻入清兵营寨，这些黄金便归谁。这一次，土伦泰拔得头筹。
如今叶尔羌汗国的可汗是阿卜杜拉，他的二弟阿布伦·穆罕默德·阿济被任命为吐鲁番总督，赛伊特·巴拜被任命为哈密总督。阿卜杜拉专注于铲除国内豪强，与西方的吉尔吉斯人、北方的卫拉特蒙古征战，不想参与东方事务。当得知清军已经统治了陕西之后，他命阿济派遣使者来到北京道贺修好。但巴拜却不这么看，他的儿子土伦泰与米喇印、丁国栋交好，因此了解了很多中原的情况，认为中原人不肯接受清朝的统治，明朝还有很强大的军队，清朝不一定能长久。同时，巴拜野心勃勃，觊觎叶尔羌汗位已久，阿卜杜拉是用武力夺取的汗位，即位之后又大杀国内贵族，统治并不稳固。巴拜认为，现在阿卜杜拉站到了清朝一边，那么如果清朝败了，明朝重新一统天下，还会对阿卜杜拉有好感吗？如果自己帮助明朝打败了清朝，将来与阿卜杜拉、阿济相争之时，明朝就会支持自己，就算不能夺取叶尔羌汗位，也能占领吐鲁番，与阿卜杜拉分庭抗礼。所以他授予土伦泰调动领地内兵员牲畜的权力，让他去支援明军。
土伦泰自己却没这么多想法，他是个头脑单纯的武夫，既然朋友有难，父亲又支持，自然要放手大干一场。他率领部下勇士，挥舞四尺大刀左劈右砍，蒋国泰和扎穆素二人也率部杀入。明军虽然只有一千多人，但气势如虹，清军阵地上一片混乱，郭君镇挥军大进，明军如潮水般涌了上来。
“弟兄们，这是我们西军打回老家之后的第一战，别让闯军的兄弟抢了先！”王复臣率领西营前锋当先杀入，刘文秀、白文选、王文耀等人紧随其后。这一战明军没什么战术，吴三桂是沙场宿将，就算刘文秀和郭君镇设计骗他，他也绝不会上当。既然兵力占优，士气旺盛，那就直接以多欺少，乘锐而进。在明军的全线进攻下，清军左支右绌，处境艰难，但是关宁军毕竟也是久经战阵的强悍之师，依然坚持抵挡，并不崩溃。
张献忠死后，西军的士气着实消沉了一段时间，大家一时都不知该往何处去。孙可望、李定国、刘文秀、艾能奇四人对军队进行重新整顿，约束军纪，严禁伤害百姓。加入武昌朝廷麾下之后，西军将士们又渐渐有了目标。此次刘文秀出川抗清，高一功接待周到，给他们补齐了粮食豆料、铠甲军械，又把零散来投的两千义军拨到了刘文秀麾下，更向刘文秀许诺，他的兵马北上之后每损失一个老兵，就增补两个新兵，这让刘文秀甚感欣慰。当年一起造反之时，高一功便以厚道著称，他为人仁厚宽和，没有权力欲望，待朋友推心置腹。不少人都反对增兵给刘文秀，但高一功坚持说，西军是军纪严明、战斗力强大的军队，新兵拨到刘文秀的队伍里，能很快形成战斗力，现在国难当头，以抗清为第一要务，只要能让这些空有热血却不懂军事的义军尽快学会打仗，怎么样都可以，不仅是刘文秀，就是明军降将贺珍、孙守法都获得了补充。只有武大定是个例外，此人反复无常，所部又军纪败坏，高一功就是再宽仁也不能给他增兵。相比之下，其实孙守法杀的农民军比武大定更多，但是武大定是农民军的叛徒，孙守法却从来都是明军。陕西明军将领中只有孙守法一人在孙传庭兵败后没有投降李自成，宁肯躲进山里风餐露宿，直到朱慈烺即位他才同意归顺，就算是敌人，他也是一条值得尊敬的好汉。
西军蓄锐已久，此时一旦出鞘，立刻让清军难以抵敌。王复臣骁勇无比，冲锋在前，其部精骑所到之处，清军当者披靡。刘文秀是延安人，王复臣是葭州人，白文选是吴堡人，都是少年之时即追随张献忠的陕北老兄弟，一路之上，陕西父老痛诉清军屠掠之惨，何洛会等人本是外族，烧杀淫掠倒也不奇，吴三桂、孟乔芳之流身为汉人却为虎作伥，可恨之处更胜满洲兵十倍。西军从来没和清军交手过，没有关宁、宣大明军那种畏敌如虎的情绪，真满洲兵尚且不怕，何况是伪军。负责阻击西军的杨坤、卫之屏、郭云龙、白含贞等人抵挡不住，不得不放弃了一部分阵地，向后退却。就在这时，府谷的城门打开了，高友才挥兵杀出。
在明军的前后夹击之下，清军感到越来越吃力，吴三桂判断，如果他死战到底，明军也不见得能打下他的营垒，但是这般死拼硬打，把老本都拼光了，自己以后也没法再混了。他对这种情况早有准备，在感觉明军有可能来袭时，已经命令张国忠、高魁二将和绿营董学礼部把黄河上的船只扎成浮桥，现在浮桥已经扎好，吴三桂下令各部交替掩护退出阵地，由浮桥退回山西。
吴三桂有心把绿营留下断后，让自己的嫡系部队先行渡河，可是董学礼部就是负责把守黄河渡口的，吴三桂没法强行让他留下，其他绿营部队的位置也都比吴军更靠近浮桥，一听说撤退，都想渡河先走。绿营将领们都得知了豪格在商原失利的消息，早就没了斗志，张国忠和高魁只顾阻拦其他绿营，任由董学礼部渡过了黄河。
混乱之中，有一队绿营兵冲了上来，其他清军胆敢拦路，他们便挥舞棍棒一顿殴打。张国忠大怒，心想是谁这么大胆，带着几名亲兵上前查问，不料走到近前，忽听砰砰几声铳响，张国忠和一名亲兵栽落马下。
由于渡口乱成一团，除了几个亲兵之外谁也没注意张国忠怎么了，绿营兵和吴军还在互相推搡打骂：“滚蛋！老子在蓟镇就投降了，你他妈才当几天绿营！”“你敢打老子？老子的妹夫是阿哈将军的包衣！”在扭打之中，一个“绿营兵”的头盔被扯掉了，几名清兵叫道：“他没辫子！”
“老子是堂堂正正的人，当然不长猪尾巴！”这名“绿营兵”挥起大棒，正砸在一个清军脸上，黑色的眼珠、红色的鲜血、白色的脑浆一起喷出。紧接着又有人喊道：“那个骑马的是郭毓奇！他们是明军！”“胳膊上缠着白布的都是明军！”郭毓奇一声令下，化装成清军的众明军纷纷亮出白刃，大砍大杀，渡口一片哀嚎之声。
隔河望见这一切的董学礼毫不犹豫地下令：“点火，把桥烧掉。”