谭文、谭诣、谭弘三兄弟一见袁宗第的部队过了三峡，立刻派人前来输诚，这哥仨是比较识时务的，他们所长的是水战，在陆战中绝不是闯军的对手。闯军经过历次大战的损失，兵力很不足，就算是吞并了左良玉的部队，也依然没有超过十万人。派到各省的权将军只能每人带一万人左右的军队。袁宗第部由于四川局面复杂，才格外加强到一万五千人，去贵州的刘体纯部只有八千人。因此，袁宗第必须一开始就招降一批本地军阀，作为补充力量。虽然三谭的兵马军纪涣散，实在算不上什么好部队，但毕竟是第一个来投诚的，又能补充袁宗第缺乏的水上力量，因此袁宗第也就不追究他们过去干过什么。谭文授果毅将军之职，谭诣、谭弘授威武将军之职，随袁宗第占领了夔州。
从夔州继续西进时，麻烦就来了。湖广的黄朝宣、张先壁是被李自成和张献忠轮番教训过的惊弓之鸟，故而很好对付。广西的瞿式耜、焦琏心存忠义，依然保有对大明朝廷的尊重，所以也可以和他们讲理。可是四川的军阀们就不一样了，他们在和张献忠的战斗中屡屡得手，认为流贼也不过如此，对闯军并无畏惧，他们一直在天高皇帝远的地方自力更生，对朝廷权威的尊重也非常有限。袁宗第派人去册封曾英为制将军、仙游伯，曾英倒是客客气气地回信，又回赠了礼品，但是信中却全是空话套话，对于改编问题只字不提，更没有邀请袁宗第来重庆的想法，很显然是想维持一个听调不听宣的状态，长期割据重庆。对摇黄十三家，袁宗第本以为过去一同造反的时候与他们有交情，拉拢他们应该比较简单，可没想到袁韬说自己是王应熊的部下，不能擅自做主。此时王应熊已经率领王祥、皮熊接受了刘体纯的改编改变，跑去武昌当他的大学士了，袁韬摆明了是推脱。而且他唯恐闯军来了之后要严肃军纪，于是抓紧时间抢劫财物，掳掠妇女。四川的士绅都开始怀念当年李自成的追赃助饷了，毕竟李自成还算讲道理，一般情况下拿到钱就把人放了，而袁韬却一点底线都没有，滥行杀戮，淫辱妇女。
如果积极投靠的是曾英，阳奉阴违的是三谭，袁宗第就会毫不犹豫地出兵荡平三谭，可是现在这仨人品不济的归顺了，曾英却不肯合作。曾英的名声不错，而且也颇有能力，如果仅仅因为他没有积极接受改编就消灭他，不仅白白损耗兵力，更难服川人之心。袁宗第决定先对离自己最近的袁韬下手，扬刀立威。
摇黄十三家是十余家农民军的联合，人数有多有少，战斗力有高有低，军纪有好有坏。他们长期游离于闯军和西军两支农民军主力之外，也不愿意接受明朝招安，很明显胸无大志，没有什么政治主张，这样的队伍是很容易分化收买的。闯军早年间曾经转战于四川，那时就和摇黄十三家有接触，“十三家”只是个泛称，其实二十多家都不止，而其中真正重要的有十家。袁宗第认为，杨秉胤、王友进、扈九思、马朝兴、靳可擎这五个人是可以拉拢的。这五人的人品还不错，尤其是王友进，军纪在摇黄十三家中是最好的，虽然他们都有贪财好色的毛病，但为人还比较正直，民愤也比较小，可以争取过来。白蛟龙、刘惟明二人就要差一些，军纪较差，性格摇摆不定。而张显、王高二人则完全和袁韬是一丘之貉，做事毫无底线，民愤极大，过去还曾经多次和闯军作对。
在筹划对摇黄十三家的行动之前，袁宗第还有一个问题要处理，那就是夹在他和曾英之间的石柱土司。
石柱土司马氏是对明朝比较忠诚的土司家族之一，但是石柱土司之所以名扬天下，却是因为前代土司马千乘的夫人秦良玉。在中国历史上的所有女将军中，秦良玉声名最著，战功也最为煊赫。她率领“白杆兵”征战沙场四十余年，无论是抗击清军、镇压土司叛乱还是镇压农民军，她都有赫赫战功，明末农民军的三大豪帅中，张献忠、罗汝才都是秦良玉的手下败将。李自成没有被石柱土司打败过，但正因为如此，闯军和石柱土司之间有血海深仇。崇祯六年，秦良玉的儿媳张凤仪在河南参加围剿农民军的战斗，死于闯军之手；崇祯十五年，秦良玉的儿子马养麟负责镇守襄阳，由于左良玉弃城而逃，马养麟部成了孤军，但是他为给妻子报仇，依然选择与闯军血战到底，最后兵败被杀。袁宗第在武昌时，曾经与刘宗敏专门研究过石柱土司的问题，但是最终也没有想出能招降秦良玉的办法，儿子儿媳被杀的大仇，她岂能不报。袁宗第派新任的重庆知府胡际亨前去册封秦良玉为太子太保、忠侯，又派了几个容美田家的人去做说客。秦良玉接受了大明朝廷的册封，对于使者也算客气，但是丝毫未提闯祸军之事。本来袁宗第想对石柱土司暂且置之不理，闯军现在打着大明朝廷的旗号，秦良玉就算不合作，也不会主动袭击闯军。可是到了四川之后他发现，秦良玉的侄子秦翼明控制了忠州，掌握了长江水道，如果不收编或消灭石柱土司，就无法从夔州前往重庆，曾英之所以敢抗拒改编，也是一万年有石柱土司做屏障才有恃无恐。
谭文熟悉川东的情况，他对袁宗第说，崇祯十七年时，秦良玉被张献忠的义子张定国打败，损失惨重，白杆兵的实力大不如前，而且水师力量薄弱，就算不靠袁宗第从湖北带来的张礼、叶云林指挥的闯军水师，仅靠三谭水师也足以击败他们。如今云阳、万县的明军都已经接受了闯军的改编，谭文建议以他们三兄弟作为先锋，突袭忠州，一举歼灭秦翼明所部，这样一来，秦良玉也就无力再威胁闯军了。
可是袁宗第不愿意这么做，消灭秦翼明容易，可这样一来，石柱土司也没有能力再抗清了。白杆兵是抗清有功的英雄部队，就这样不明不白地死在内战中实在是太可惜了。袁宗第能理解秦良玉的心情，她对闯军的敌视是有原因的，同时袁宗第也知道，秦良玉更痛恨清军，二十三年前，她的兄长秦邦屏、秦邦翰都战死在了浑河血战之中，石柱土司与清军有不共戴天之仇。秦良玉会选择一家一姓的私仇，还是家国大义？袁宗第对这位老将军有信心。