木叶三十六年，火之国与风之国签订停战协议，木叶南方边境的压力全部消失。

　　北方，雷之国与土之国依旧在交战状态，同时，土之国在雨隐依旧投入了一部分兵力。

　　年初，土之国岩隐村暗中联系了草之国忍村首领及大名，在付出了不知名代价之后，草之国与土之国结盟，然而，在木叶边境试探的时候被木叶暗部发现。

　　随后木叶暗部部长、木叶白牙旗木朔茂派遣精锐小分队探查情报，成功发现了岩隐村的密谋。此战，木叶情报小队队长‘透’为掩护情报阵亡，尸体被支援部队敛回，下葬在暗部公墓中。

　　另，此战，岩隐村幸存人员报告了木叶暗部中有能够使用强力不知名忍术的宇智波族人，引起了各国现任影的注意，木叶在之后的日子里连续抓捕了双位数以上的各国间谍，均为此事而来。

　　当事人宇智波智久被木叶高层，尤其是志村团藏，以保护的名由撤销了暗部身份，恢复为木叶上忍。

　　一年内，由于各处执行任务且至今无失败记录，加上手中极具标识度的武器铁扇，宇智波智久在各国情报部也有了一个特别的称号：舞扇者。

　　岩隐村与草隐村眼见事情败露，在其他国家没有反应过来的时候，由草隐忍者为主力，岩隐提供帮助，向旁边的泷之国发起进攻。并专门为物资的转运和人员的流动在草之国与土之国边境部位建造了一座大桥：神无毗桥。

　　泷之国自顾不暇，岩隐村趁乱将一部分兵力投送到泷之国海岸，从云隐部队的背后发动进攻，成功得以极少的代价歼灭了云隐部队中的很大一部分，双方再次僵持在海岸线附近。

　　同年，木叶白牙旗木朔茂卸任暗部部长身份，以正常上忍身份不停执行任务，在敌对方忍者中的名号也是越来越响，甚至有的忍村下达了遇到白牙可以放弃任务而不受惩罚的命令，一时间，木叶白牙的风头一时无两。

　　四月，木叶三忍之一的自来也被强制要求回村。

　　六月，岩隐村由于多线战斗无力，与山椒鱼半藏签订停战协定，第二次忍界大战雨之国战场正式结束。

　　七月，木叶将所有的常规部队放到了边境附近，由木叶白牙和三忍分别担任指挥官，防止其他国家流窜的忍者、叛忍、山贼等进入火之国边境。

　　十二月，云隐村八尾人柱力由于过度衰老，无力压制体内的八尾，八尾再次暴走，三代雷影与其发生战斗，并最终痛苦地决定放弃人柱力，不再进行压制和重新封印原人柱力体内，用村内的特殊忍具琥珀净瓶暂时将八尾封印在里面。

　　同时，云隐村在全村甚至所有能找到的范围内发起了寻找合适人柱力的秘密行动，值得一提的是，早期由于查克拉特殊而被关注的木叶忍者漩涡玖辛奈因此在此遭受袭击，然而，这一次，漩涡玖辛奈爆发出了强大的实力，尤其是那巨大的查克拉量，让云隐执行任务的小队无功而返。

　　岩隐村得到消息后，将四尾人柱力老紫带上战场，由于尾兽巨大的破坏力，他们取得了本土战斗的胜利，将云隐村的人赶出了国境。

　　战后，四尾人柱力老紫与三代土影大野木发生极大的冲突，在还未回村的时候，敲晕了守在四周的暗部，成功叛逃隐匿了起来。

　　木叶三十七年四月，土之国岩隐村与雷之国云隐村在进行了长达半年的骚扰战和局部战争后，选择议和，于六月签订停战协定。

　　第二次忍界大战的大国战斗结束，还在发生战斗的，只剩下草之国与泷之国，他们的战争持续了将近一年的时间，与木叶三十八年年初结束。

　　至此，第二次忍界大战彻底结束。

　　在木叶三十六年到木叶三十八年内，整个忍界还发生了一些其他的事。

　　汤之国国内一个名为邪神教的教派迅速兴起，甚至一度掌握了汤忍村的大权，由于出现的突然，木叶保持着对这个教派的关注，但是并没有其他的动作。

　　雪之国在刚刚接任大名的风花早雪授意下建造了忍界第一条铁路，并开展了改善雪之国环境的研究，已经有了一部分成果。

　　铁之国，武士三船任铁之国武士部队统领，宣布铁之国彻底中立，将不再参加任何忍界的利益纷争。因其言论，各国均有不同程度的利益受损，纷纷派出忍者进行暗杀，但是全部被三船以强大的刀术斩杀在了铁之国，这之后，各国默认了铁之国作为中立国家的立场。

　　涡之国大名企图再次建立忍村，然而被得到消息的水之国再次进攻，由于没有任何能够抵抗的力量，涡之国居民全部逃难向了火之国，自此，涡之国灭亡。

　　木叶内部

　　三代火影有了隐退之意，民众中逐渐传出了第四代火影的人选，支持率较高的，有木叶白牙旗木朔茂，三忍之大蛇丸，还有顾问志村团藏。

　　纲手的恋人加藤断在战争中阵亡，心灰意冷的她向木叶高层提交了早已做好的医疗忍者培养设想，随后想要离开木叶。但由于弟弟受伤动作不便，两人最终回到了千手族地隐居，不再参加任务。

　　木叶上忍，三忍之一的自来也在忍界安定下来之后，向三代火影猿飞日斩申请了一个假期，离开木叶到忍界各地进行考察。

　　宇智波家族内，宇智波镜的孙子宇智波止水出生，由于其父母任务繁忙，被交由他的二爷爷宇智波钿进行抚养，在出生不久，就展现出了非凡的天赋，很快便学会了走路和说话。

　　宇智波富岳完成了所有的战场任务后，开始从父亲宇智波胜彦手中接手族内的事项，将在年满二十三周岁的时候正式接任宇智波一族族长一职。

　　宇智波美琴由于任务完成率相当的高，并在一次防卫任务中表现出色，被记录进入木叶的精英上忍名录中。随后，她申请退出忍者现役，开始着手学习处理族内事物，为接任三长老一脉的长老职位进行准备。

　　就这样，时间来到了木叶三十八年十月。