崇祯十一年春正月二十一日，洪承畴打败敌人在梓潼，贼逃回陕西。丁亥，裁减南京冗官。二月甲辰，改任河南巡按御史张任学为总兵官。三月十五日，贺逢圣辞官。这个月，李自成从洮州番地出，总兵官曹变蛟追击打败他，再入境，到西和、礼县。
夏四月十六日，张献忠在谷城假装投降，熊文灿接受的。戊申，张至发辞官。十八日，火星逆行，对廷臣修身反省。五月初一日，考试考选官员在中左门。六月癸巳，安民厂发生火灾，毁坏城垣，万余人受伤。壬寅，孔贞运辞官。
乙卯日，兵部尚书杨嗣昌、户部尚书程国样、礼部侍郎方逢年、工部侍郎蔡国用均为礼部尚书，大理寺少卿范又纯粹为礼部侍郎，同时兼任东阁大学士，参与机要事务。杨嗣昌仍然掌管兵部。
这个月，两畿、山东、河南发生大旱灾和蝗灾。秋七月乙丑，少詹事黄道周因谈论杨嗣昌夺情，贬为按察司照磨。八月戊戌日，因灾害怪异多次出现，居永寿宫行斋，对廷臣修身反省。
癸丑，傅冠辞官退职。戊午，停刑。罗汝才等从陕州侵犯襄阳。九月，陕西、山西大早饥荒。辛巳，大清军队进入墙子岭，总督蓟辽兵部侍郎吴阿衡战死的。癸未，京师戒严。冬十月癸巳日，卢象升入援，在武英殿召回答。
甲午，括马。卢象升、高起潜分别监督援军。这个月，洪承畴、曹变蛟大败贼在潼关南原，李自成率领几名骑兵逃跑。十一月戊辰日，大清军队攻克高阳，退职大学士孙承宗战死的。
戊子，罢免卢象升，带罪立功。刘宁亮自己请看老师，允许的。这个月，罗汝才投降。十二月庚子，方逢年停职。卢象升在巨鹿兵败，死的。
戊申，孙传庭任兵部侍郎监督援军。征调洪承畴人卫。这一年，土鲁番、琉球入朝进贡。十二年春正月初一，因时事艰难，拒绝朝臣庆贺。
庚申，大清军队进入济南，德王由枢被捕，布政使张秉文等死的。戊辰，刘宁亮、孙传庭会师十八万人在置业，不敢进。丁丑，改洪承畴总督蓟、辽，孙传庭总督保定、山东、河北。二月乙未，刘宁亮停职。清兵北回。
三月丙寅，从青山口。凡是深入二千里，查阅五月，攻下畿内、山东七十余城。丙子，加上孝纯太后溢号，下诏天下。夏四月十六日，程国样退休。这个月，左良玉攻击降贼首领李万庆。
五月甲子，礼部侍郎姚明恭、张四知，兵部侍郎魏照乘，同为礼部尚书兼东阁大学士，参与机要事务。乙丑，张献忠在谷城，罗汝才等起反应的，攻陷房县。
乙亥，孙传庭革职，不久被逮捕关进监狱。六月，畿内、山东、河南、山西早灾、蝗灾。十八日，抽调各镇精兵进行训练，再加上练兵粮饷。
秋季七月壬申日，左良玉征讨张献忠，在罗猴山失败，总兵官罗岱被抓死的。熊文灿被没收，不久被逮捕关进监狱。八月一日，下诏诛杀边境失事巡抚都御史颜继祖，总兵官倪宠、祖宽，内臣邓希诏、孙茂霖等三十三人，都弃市。己亥，减免唐县等四十州县去年田租的一半。
壬子日，大学士杨嗣昌督师讨伐贼，总督以下都听从指挥。十月初一日，杨嗣昌襄阳誓师。甲午，左良玉为平寇将军。丙申日，《钦保护人民的四件事全书》成功，颁布于天下。十一月辛巳，在南郊祭天。十二月，罗汝才侵犯四川。
丙午，下兵部尚书傅宗龙于监狱。这一年，琉球入朝进贡。
崇祯十三年闰正月三日，赈救真定饥荒。戊子，贩济京城饥民。癸卯，赈济山东饥荒。二月初一日，在束郊祭。
戊午，总督陕西三边侍郎郑崇俭大败张献忠在太平县玛瑙山，张献忠败走归州。戊寅，由于长期干旱，征求直言。三月五日，祈祷下雨。丙戌，大风沙，下诏清理刑狱。戊子，罢免各镇宦官。
丙申日，赐魏藻德等进士及第、出身不等。戊戌，赈济畿内饥荒。丁未，免除河北三府拖欠赋税。夏季四月戊午，到江西巡抚愈都御史解学龙及所举黄道周。
己卯，吏部尚书谢升为礼部尚书，礼部侍郎陈演以原官兼东阁大学士，参与机要事务。五月，罗汝才攻打夔州，石砫女土官秦国良玉连续打退他们。甲申，在北郊祭地。庚戌，姚明恭退休。
六月初一日，总兵官贺人龙等分路逐贼，失败的，罗汝才跑大宁。庚午，蔡国用死。辛未，薛国观罢。七月初一日，畿内捕捉蝗虫。己丑，从国库赈济遭受蝗灾州县。辛卯日，左良玉及京营总兵官孙应元等在兴山大败罗汝才。
罗汝才败走巫山，与张献忠会合。八月甲戌日，赈济江北饥荒。九月，陕西官军围攻李自成在巴西鱼腹山中，从成功逃脱。癸巳，张献忠攻陷大昌，总兵官张令战死。不久攻克剑州、绵州。
冬十月二十日，熊文灿被处死。十一月，杨嗣昌进军重庆。丁亥，在南郊祭天。戊子，南京地震。十二五月丁未初一，严格抄传军事机密禁令。
辛亥，张献忠攻陷泸州。乙卯日，逮捕薛国观。这个月，李自成从湖广到河南，饥饿的百姓归附的，接连攻陷宜阳、永宁，杀万安王采，攻陷偃师，势大盛。
这一年，两畿、山东、河南、山西、陕西早灾、蝗灾，人吃。十四年春正月辛巳，在南郊祭天祈谷。己丑，总兵官猛如虎追击张献忠于开县黄陵城，失败，参将刘士杰等战死，贼寇于是往东下。
丙申日，李白成攻陷河南，福王朱常洵遇害，前兵部尚书吕维棋等死的。
二月十四日，下诏因时事艰难，灾异多次出现，痛苦自责，停止今年行刑，许多犯罪都减少等论。庚戌，张献忠攻陷襄阳，襄王朱诩铭、贵阳王朱常法一同遇害，副使张克俭等死的。
戊午，李自成进攻开封，周王朱恭楞、巡按御史高名衡抗拒后退的。乙丑，张献忠攻陷光州。己巳日，召见内阁大臣、九卿、科道在乾清宫左室。
命令驸马都尉冉兴让等携带资金救济河南受灾宗室。三月丙子朔，杨嗣昌从四川回来，到荆州死去。乙酉，祈祷下雨。
丙申日，洪承畴会合八镇兵在宁远。丁酉，逮捕郑崇俭下狱，不久弃市。夏四月十三日，大清兵攻锦州，祖大寿奋力抵抗。
自己不，总督三边侍郎丁启睿为兵部尚书，督师讨伐贼。五月初四日，范复粹辞官。从狱中释放傅宗龙，任命他为兵部侍郎，总督陕西三边军务，征讨李自成。戊子，在北郊祭地。
六月，两畿、山东、河南、浙江、湖广早灾、蝗灾，山东盗贼兴起。秋季七月己卯日，李自成进攻邓州，杨文岳、总兵官虎大威打败他。壬寅，洪承畴增援锦州，驻军于松山。
这个月，临清运河干涸。京城大瘟疫。八月乙巳，前来救援的军队交战于松山，阳和总兵官杨国柱溃败战死。辛亥，赐薛国观死。
辛酉日，重建太学，释奠先师孔子。甲子，总兵官吴三桂、王朴从松山逃跑，各路军队夜间崩溃。这个月，左良玉在信阳大败张献忠。九月丁丑，傅宗龙率军驻扎新，与总督保定侍郎杨文岳会师。
己卯，遇上贼，贺人龙全军溃败，宗龙被包围，文岳逃往陈州。甲申，周延儒、贺逢圣再次入阁。辛卯日，封皇子朱慈炯为定王。
壬辰，傅宗龙突围而出，直奔项城，被抓死的。贼军屠戮项城及商水、扶沟。戊戌，李自成、罗汝才攻陷叶县，守将刘国能死的。这个月，官军打败张献忠在英山望云寨。
冬十月癸卯朔，天上日食忽氟。十一月丙子日，李白成攻陷南阳，唐王朱幸镇遇害，总兵官猛如虎等死的。十二月，李自成接连攻陷洧川、许州、长葛、鄢陵。甲子，解学龙戍边、黄道周。
李自成、罗汝才合力攻打开封，周王朱恭楞、巡抚都御史高名衡抗拒。十五年春正月癸未，孙传庭任兵部侍郎，统领京军救援开封。乙酉，杨文岳救援开封，敌人撤退了，南陷西华。
戊子，免天下十二年以前拖欠的赋税。这个月，山东贼攻陷张秋、东平，抢劫漕运船只。太监王裕民、刘元斌率禁兵会合充东官军讨伐平定了他。二月十四日，赈济山东去安抚战乱百姓。
癸丑，总督陕西都御史汪乔年暂住襄城，遇上贼，贺人龙等人逃到函谷关，乔年被包围。丁巳，城陷，被抓死的。戊午，大清军队攻克松山，洪承畴投降，巡抚都御史丘民仰，总兵官曹变蛟、王廷臣，副总兵江翥、饶勋等死的。
这个月，孙传庭总督三边军务。三月，李白成攻陷陈州。丁丑，魏照乘辞官在。己卯，祖大寿以锦州向大清兵投降。辛卯日，李白成攻陷睢州、太康、宁陵、考城。壬辰，封皇子慈暖召为永王。
丙申日，李白成攻陷归德。这是春天，江北贼攻陷含山、和州，南京戒严。夏四月癸亥，李自成又包围开封。乙丑，谢升革职。五月十四日，孙传庭人关，诛杀贺人龙。
甲戌，张献忠攻陷庐州。丁亥，王朴弃市。六月戊申日，贺逢圣辞官。癸丑，张四知辞官。甲寅，下诏天下停刑三年。
自己不，詹事蒋德溉、黄景意，戎政侍郎吴牲，同为礼部尚书兼东阁大学士，参与机要事务。庚申，下诏孙传庭出关。兵部侍郎侯询督领左良玉军队增援开封。
壬戌，以一起推举阁臣下吏部尚书李日宣六人在监狱，贬谪戍边。甲子，在北郊祭地。这个月，筑坛亲自祭祀死去的文武大臣。山西总兵官许定国增援开封，在沁水溃败，宁武兵在覃怀溃败。
秋季，七月二十日，左良玉、虎大威、杨德政、方国安四镇的军队溃败在朱仙镇。八月四日，安庆兵变，杀都指挥徐良宪，官军征讨平定了。乙丑，释放黄道周在戍所，恢复他的官职。
丁卯，兵部尚书陈新甲下狱，不久弃市。九月壬午，贼决黄河灌溉开封。癸未，城墙倒塌，士兵被淹死的有十万人。己丑，孙传庭率军前往河南。辛卯日，凤阳总兵官黄得功、刘良佐在潜山大败张献忠。
冬季十月辛酉日，孙传庭失败在郏县，跑入关。十一月丁卯日，援汁总兵官刘超占据永城谋反。庚午，从国库赈济开封受灾宗室兵民。壬申，大清兵分路入塞，京师戒严。
命令功臣分守九门，太监王承恩监督检查城防。下诏推举可以担任督师大将的人。戊寅，征调各镇兵人京救援。庚辰，大清军队攻克蓟州。丁亥，蓟镇总督赵光提调援军。戊子，张献忠攻陷无为。
己丑，辽东督师侍郎范志完入援。闰十二月癸卯日，下诏罪己，求直言。壬寅，大清兵南下，畿南郡邑多不守。丁巳，从废率。这个月，李白成攻陷汝宁，前总督侍郎杨文岳、佥事王世琼宁死不屈死。
十二月，大清兵直捣曹、濮，山东州县相继下，鲁王因为派自杀。自己日，李白成攻陷襄阳，根据的。左良玉逃奔承天，不久到武昌。贼兵分兵攻下德安、彝陵、荆门，于是攻陷荆州。癸巳，烧献陵