王莽的政权在声势浩大的起义的打击下风雨飘摇,其内部的危机也更加严重。王莽的过度怀疑使他对身边人越来越不信任,滥贬大臣,其他人也对王莽逐渐失去忠心和支持。大臣的背叛事件一天比一天多,而王莽的儿孙还在一旁觊觎着皇位,妄想取而代之,自己成为皇帝。
经过这几件事后使大臣离叛更积极始建国二年,发生了甄丰父子的谋叛,因此数以百计的中央和地方官员因牵进该案而遭诛杀。地皇二年,魏成大尹李焉与其卜者王况密谋要将王莽诛杀、然后取而代之的计。不料遭暗探(奸细)的告密,使王莽先一步将李焉等人格杀。地皇四年,三辅地方爆发了多次反对王莽统治的起义,但虽然强烈,仍可以勉强控制。王莽的重要心腹王涉、此时备受冷落的刘歆、大司马董忠,准备投降来稳固自身利益。不过这次密谋又被人告密了,王莽知道后内心震惊后暗中部署将他们诛杀。(这王莽运气真一好,奸细遍地,为他服务,让他不被暗中捅刀)之后,朝臣(中央,地方)都在暗中留下后手。这使君臣离心,使政权加速瓦解。
朝堂之事都已经让王莽焦头烂额,四处奔波,但后宫和家族接连出事更让他痛心疾首和身心俱惫。
天凤五年,王宇的儿子王宗,让人暗中制造了自己代替王莽做皇帝的符命,上演他父亲夺权的一幕,王莽发现后,好一个儿子敢杀父,大怒气得急跳脚,逼迫王宗自杀。同时王莽还把这次牵连在内的人全部杀掉,其中就包括王宗的姐姐王妨和丈夫王兴。
地皇元年,王莽以王路堂被毁为借口,废除了早有异心的太子王临。地皇二年,王莽妻子病危,王临不被允许进京探视,只得写了一封书信诉说自己的苦闷。不料信落到了王莽手里,于是王莽逼王临饮药自杀。王临死后不久,王莽的另一个儿子,新迁王王安也病死了。
这样,王莽正妻所生的四个儿子皆已死去,加上做了平帝皇后、早已守寡的女儿,和被杀的孙子、嫁给废人孺子婴的孙女,王莽可谓是孤家寡人了(寡人),这他真做到了,不过是众叛亲离的结果。
面对四处起义,为稳定民心,他便自欺欺人上演了一场政治骗局公元23年,王莽在南郊举行哭天大典。地皇四年(公元23年),起义军(绿林军)攻入长安,王莽在王揖等护卫下逃往渐台,公卿大夫、宦官、随从还有千余人。守城的王邑日夜搏斗,部下死伤略尽,也退至渐台。这时他的儿子、侍中王睦正想脱掉官服逃命。王邑将他喝住,父子俩一起守着王莽。最后随从王莽的千余人全部战死或者被杀。王莽被起义军战士(商县人杜吴)所杀,校尉公宾就向杜吴问王莽的尸身在哪,杜吴告诉他在“室中西北陬间”,公宾就斩了王莽的首级,悬于宛市之中,数十个军士争相杀王莽,分裂了王莽的尸体。百姓们听说王莽的首级在宛市,‘共提击之,或切食其舌’,可见百姓对其的恨意滔天。
新朝灭亡,王莽的头颅,被后来历代皇室所收藏,直到公元295年晋惠帝时,洛阳武库遭大火,遂被焚毁。