段天罡前往京城找周成谟报仇，不料京城四门紧闭，禁止任何人出入，直到三天之后，城门方才开启。入城后却得知了一个惊天动地的消息：大将军丁献在各大家族支持下，率领兵马杀入皇宫，将奢渝皇陆氏一族灭绝。
皇城混乱，周氏家族戒备森严，甚至有数千禁军守护。段天罡不敢轻举妄动，只在周府之外徘徊。却在无意之中得知，京城欧家因帮助澄羽帝对抗叛军，惨遭灭门，就连欧景川也死于乱军之中，欧语蝶自尽身亡。丁献初登奢渝皇位，颁下圣旨，大赦天下，又迎娶周氏嫡女，册封为后。
段天罡大恸，身穿孝服前往皇宫，丁献却避而不见，只遣近卫送来一封信：“事已至此，多说无益，你若愿意为官，暂且去驿馆中耐心等待。若不愿为官，尽早离开京师，免生是非。周家已是后族，不得伤害周氏族人。”
在周家大宅外等候了五天，段天罡终于寻了个机会，斩杀了准备出门的周成谟。却遭到周家供奉的拼死追杀，又惊动了巡街卫兵，段天罡虽然逃脱险境，却身受重伤，为红叶村赖子乔所救。
原来，陆子横身死后，赖子乔执意要为他复仇。这几日他也在周府周边寻找机会，不想却发现了身受重伤的段天罡，便偷偷地将其带回了住处。
段天罡受伤颇重，赖子乔请来了济世道门的玄通道长，在玄通的协助下，段天罡离开京城，在济世道门中养伤。
养伤半个多月，济世道门却迎来了丁献的圣旨。丁献认为，永济大陆各国征战不休，奢渝国遭群狼虎视，危在旦夕。唯有朝野上下齐心合力，方有希望打败强敌，望济世道门上体天心，并入清虚宗，为天下苍生谋万世福祉。
原来，丁献能登基为帝，背后竟有清虚宗支持。清虚宗门人弟子众多，修为不俗，但是世俗经济之道却不擅长。他们早就看中了济世道门行医制药之法，若能借此垄断奢渝国医坊、药坊，清虚宗绵延万载都不是问题。这道圣旨，就是丁献与清虚宗的交易。
在济世道门掌门法巳道长的央求下，段天罡护送济世道门十几名核心弟子，杀出官兵重围，投奔昭武国寒月山。
法己道长则召集门人于祖师殿前，焚香祭祀，直言己过，宣布解散奢渝国济世道门，任凭弟子去留。济世道门将于昭武帝国寒月山重开山门，望各弟子门人善自珍重。言毕，法己道长服毒自尽。众弟子大恸，当场竟有数百人围坐于法己身前，一一服毒自尽。
段天罡等人拿着法巳道长的书信和信物，来到昭武国寒月山。济世道门在寒月岭叠翠峰重开山门，段天罡则拜入了寒月山。
在寒月山修习数年，段天罡修为渐深，结识了女扮男装的杨思馥。两人历经无数患难，终于发现杨思馥实为女儿身，两人之间的感情早已无比深厚。
杨思馥恢复女儿装，向段天罡袒露了自己的身份：二十多年前，称霸永济大陆的永安帝国老皇驾崩，七子争位。导致永安帝国被奢渝、燕然、昭武和北魏四大强国吞并。七皇子杨弘渊深知大势已去，裹挟麾下六城数百万子民，跨海北渡，在蛮荒大陆扎下根来，建立了拒安国。
拒安国建立后，向永济大陆派遣了数千名训练有数的种子，遍布整个永济大陆各国，一方面挑起各国之间的战火，另一方面发展势力。当年栗源城所遇的杨九子，便是拒安国种子之一。
杨思馥身为杨弘渊长女，身负重返永济大陆的重任，常年乔装打扮，在永济大陆中活动。因与段天罡有了感情，方才袒露了自己的真实身份，她希望段天罡能够帮助拒安国重返永济大陆，彻底消除永济大陆的战火。
段天罡知晓事情，悲痛欲绝，他最痛恨的幕后黑手，竟是自己心爱的女人！伤心之下，段天罡离开了寒月山，离开了昭武国，游走于永济大陆各处险地，探寻古迹，旨在寻找天门祸患的真相。
在蛮荒古域的裕溪蛮族，段天罡终于找到了真相。数万年前，永济大陆天地灵气极为浓郁，无数修士飞升天庭，并组建了一个十分庞大的势力，名唤天门。天庭各界对天门极为忌惮，纠集了各族仙人，共同向天门开战，最终，天门中的仙人被灭绝。
然而，天庭各界仍不罢休，他们派遣了大量仙人进入永济大陆，斩断天地灵脉，诛除将各大宗派，毁灭了各种修行功法。当他们想要毁灭永济大陆所有生物时，却遭遇了部分派系的抵制。多方妥协下，天庭各界在永济大陆布置了强大的法阵，一旦发现有仙人飞升天门，必会遭遇法阵攻击。
为限制永济大陆修行界的发展，天庭各族还掌控了天门，并将所有结丹期以上修士全都吸收进天门中，制定了结丹期以上修士不得插手凡俗事务的规矩。
除此之外，天门还在凡俗中发展各类隐形势力，许多传承久远的家族，都受天门掌控。其目的，就是要永济大陆战火不断，不让修行界有良好的成长土壤。
至于裕溪蛮族，他们是从灾难中幸存下来的修行者。为了应对天门，他们组建了暗影殿，永济大陆之所以重新萌发了修行体系，就出自于他们暗中的操控的结果。《青云录》等功法，就是从暗影殿传出，成为了当年永安帝国的皇家功法。至于《炼体锻魂诀》，却是天庭中一位仙人暗地里传到永济大陆的一门功法。
段天罡在裕溪蛮族中修行十年，并通过暗影殿的帮助，破坏了遍布永济大陆各地的阵基，使天门的阵法失去作用。在即将飞升的时候，杨思馥寻到了裕溪蛮族，告诉段天罡，永济大陆已被拒安国统一，从此大陆上不会有大的战争。她放弃了公主的身份，想要陪在段天罡身边。
段天罡终于想通了，在裕溪蛮族迎娶了杨思馥。陪伴三年后，踏上了飞升之途，他要去解决天庭界的威胁。（全书完）