无双
第三代火影打算让卡卡西负责新毕业的三个学生:漩涡鸣人、宇智波佐助、春野樱。鸣人等人刚从学院毕业后,卡卡西就成为鸣人、佐助及小樱这些下忍的带队老师,但是卡卡西再为他们这些毕业生安排生存测试,若不能通过就要求他们重返学院学习。历年来均没有人成功通过卡卡西的下忍测试,卡卡西的下忍测试,是要求鸣人他们在中午前,夺去绑在自己腰间的两个铃,由于只有两个,故此队中最多只有两人能成功通过考试,一人则被淘汰,被淘汰者非但没有饭吃,更可能被评为不合格而重返学院。卡卡西亦要他们以抱着杀死他的心,才有机会夺去他手上的铃。三人当中,鸣人的表现最差,他非但不隐藏起来,还大模大样地向他挑战,结果被卡卡西以体术秘技——“千年杀”击飞。之后又中了卡卡西设的简单陷阱,两次被吊在树上,被卡卡西批评为“只会横冲直撞,破绽百出”。相反,樱及佐助比较冷静,他们一开始就隐藏起来。佐助趁卡卡西向吊在树上的鸣人讲解时,掷出手里剑攻击他,但却只打中他的替身。后来再度遇上卡卡西,其身手及智谋,以及使出火遁·豪火球之术,令卡卡西不得不承认其天赋。但最后仍被卡卡西以忍术土遁术·御杀斩首术埋在地下。
卡卡西批评佐助只喜欢个人主义,不明白队伍合作的重要性。至于樱,一如以往只担心佐助。所以当佐助的偷袭失败后,就去找佐助。途中却中了卡卡西的幻术,身受重伤的佐助向他求救,她立刻被吓得晕倒。醒来后,误以为佐助真的有生命危险,故继续找佐助。但当看见被埋在地上,头部外露的佐助跟他说话时,便以为是死去的佐助在和她说话,二话不说再次晕倒。结果,三人都不能在中午时份抢到卡卡西的两个铃,鸣人更因欲偷走测试中准备的食物,被卡卡西缚在木柱上。卡卡西说他们三人跟本没资格当忍者,连返回学院的资格也没有。卡卡西也说出测试的真正目的,就是要他们表现“团队合作”的重要性,即使面对自己可能要被淘汰出局,也能放弃个人利益,跟伙伴一起合作;那些只顾自己表现及不重视队友的人,是不能做忍者的,之后又向他们展示了旁边石碑上殉职的英雄。
后来卡卡西“手下留情”,说又再给他们一次机会,但却不准许樱及佐助给鸣人食物。就在卡卡西离开后,佐助深明卡卡西真正的意思,私下给鸣人食物;樱看见后,也把自己的一份给鸣人吃。卡卡西突然出现,告诉他们已经过关,因为他们不像以往考生那样,没有自己的想法,亦没有重视伙伴的精神。卡卡西和鸣人等人接受了C级任务,要护送建筑工人达兹纳回国,但途中遇上被波之国无良商人卡多雇佣的叛忍桃地再不斩和白,卡卡西两次与再不斩交手。第一次,卡卡西中了再不斩的计谋,被水牢之术困住,幸好鸣人及时相救。之后卡卡西使用写轮眼,复制再不斩的水遁·水龙弹之术,将其击败,但也因为查克拉消耗过大休养了一段时间。
第二次,卡卡西使出追牙术,困住再不斩,然后使用雷切,但这一招却被白拼死挡住,见白已死,心灰意冷的再不斩牺牲了自己的性命,反过来把作恶多端的卡多杀死。根据他临终前的托付,卡卡西把再不斩、白连同再不斩的斩首大刀葬在一起。在中忍考试中,卡卡西一直在旁边观看鸣人等三个学生的比赛。当佐助在第一战胜出后,卡卡西就把大蛇丸留在佐助脖子的天之咒印暂时封印。然而却遇上了传说中“三忍”之一——大蛇丸,企图带走佐助,卡卡西便向大蛇丸展示自创秘技--雷切及开启写轮眼,还警告大蛇丸如欲带走佐助,决定与他同归于尽。
不过大蛇丸就暗示卡卡西根本没有这种能力杀死他,但亦没有立刻带走佐助,转眼便离开了。卡卡西亦意识到自己没有杀死大蛇丸的能力。后来卡卡西在第三场正式考试前,努力训练跟他有相同“雷”属性的佐助。卡卡西对佐助进行了多日刻苦的训练后,终于让佐助完成可克制我爱罗“砂防御”的“千鸟”;并在佐助比赛资格快要被取消的那一刻,及时把佐助送到中忍考试会场内。然而,就在佐助跟我爱罗进行激战之际,大蛇丸突然对木叶隐村发动了攻击,而佐助亦追赶被千鸟打伤的我爱罗。
另一方面,卡卡西则解开了音忍药师兜对会场观众释放的幻术,他命令春野樱把中了幻术的漩涡鸣人及奈良鹿丸唤醒,并跟忍犬帕克一起、前往阻止佐助追击我爱罗。大蛇丸更联同砂忍合力进攻木叶村,我爱罗的任务之一就是在大蛇丸进攻的同时发动一尾,可惜由于他的情绪波动在中忍考试时已经提前发动了一尾,但被佐助的千鸟打伤后被手鞠和勘九郎带走,之后他安定下来再次发动一尾,佐助赶上跟我爱罗大战,可惜佐助始终不敌一尾,一尾正想杀佐助之时呜人及时赶到救下佐助,更发动前所未见的力量最后和我爱罗打得两败俱伤。卡卡西则联同阿凯,应付密集如云的音忍及砂忍。结果大蛇丸计划失败,但三代火影亦付出了自己的生命。就在第三代火影的丧礼进行前,卡卡西自己一人前往英雄慰灵碑处,悼念过去死去的队友——宇智波带土。就在木叶崩溃战后不久、百废待兴时,两名隶属于神秘组织——“晓”的S级叛忍来到了木叶村。此时,卡卡西刚好赶到,复制鬼鲛的水鲛弹之术,并把鬼鲛逼退。自佐助执行任务以来,多次需要鸣人的协助才能逃过危机,于是佐助开始对鸣人的能力感到嫉妒。卡卡西对此是非常清楚的,于是当佐助跟鸣人在医院天台对战时,他及时阻止二人的战斗,并化解了他们的螺旋丸及千鸟攻击。晓组织捉去了拥有一尾力量的人柱力第五代风影我爱罗。砂忍向木叶求援,木叶派出卡卡西班,砂隐的千代婆婆其后一同加入。第五代火影纲手再派出凯班作增援,两班分别在途中遇上‘晓’的成员鬼鲛。后来与鸣人合作,及鸣人使出螺旋丸加强版--大玉螺旋丸击败。之后再遇上“晓”的成员迪达拉及赤砂之蝎,迪达拉以我爱罗的尸体把性格冲动的鸣人引开。为了避免鸣人独自行动,他从后面追赶鸣人,留下樱及千代婆婆暂时应付蝎。为了节省时间,卡卡西开启了万花筒写轮眼使用神威。但是此时卡卡西对他新的写轮眼还不熟悉,还不能熟练的控制结界空间的位置和大小,瞳术打偏到了迪达拉的右手上,而且卡卡西在体力方面亦明显不能支撑这种术,很快就感到疲惫。掉下巨鸟的迪达拉变出分身,欲把他们全部炸死,卡卡西又用神威把他和爆炸一起转移到了另一个空间。由于连续使用两次万花筒写轮眼,卡卡西需要休息一段时间。期间由来自暗部的天藏暂代七班的队长。猿飞阿斯玛在对决晓不死组合飞段、角都时牺牲,第十班矢志为老师复仇。卡卡西主动请缨,暂作为第十班的队长,去寻找飞段、角都。甫一对战,卡卡西便用写轮眼看出了角都的土属性结印并以雷切破了其土遁硬化术并刺穿其心脏。谁知对方拥有多个从其他忍者抢来的心脏所以没有死。并且角都能使用心脏所属属性的忍术。后飞段去攻击卡卡西,角都在后面攻击,企图利用飞段的不死之身将卡卡西消灭,所幸被卡卡西及时躲开。后卡卡西发动双手雷切替第十班成员挡去了角都的伪暗。这时候局面以一敌二,非常不利……连续的消耗使卡卡西喘不过气来;不过,最令卡卡西惊讶的,就是角都居然曾经跟初代火影对战过。
这时角都欲以卡卡西的心脏填补被雷切摧毁的心脏。面对角都的风火遁攻击,卡卡西用水阵壁抵挡,但风火克水;趁卡卡西不注意,角都用“地怨虞”将他绑住,准备强行用血管挖出卡卡西的心脏。然而,卡卡西在之前就取得了角都的血液并把它交给鹿丸,飞段被鹿丸所骗误用角都的血液使用咒术,角都心脏被破倒地。但角都却突然将全身的触手伸出,把卡卡西他们绑着,情况不利。卡卡西欲使出万花筒写轮眼,这时大和,鸣人等赶到,最后角都被鸣人的风遁螺旋手里剑击倒。而卡卡西以雷切击败倒在地上、动弹不得的角都,摧毁他最后一个心脏,后把角都的尸体带回木叶村给纲手研究。为得知晓的情报,木叶决定锁定面具男,新七班和第八班联手行动。后众人与“晓”的新成员——一个戴着面具、自称“宇智波斑”的神秘男子对战。“面具男”凭借出神入化的时空间忍术将木叶众人玩弄于股掌之中,众人的攻击均对其无效。
佩恩六道突然来袭,木叶陷入混乱局面。正当伊鲁卡老师照顾受伤的木叶忍者时,遇上了佩恩天道,幸好卡卡西及时相救才没事,卡卡西快速躲开佩恩的攻击,并结印召唤土流壁,欲以雷切攻击,却被佩恩使用神罗天征弹开。卡卡西又召唤雷分身,发出雷犬试探。可是雷犬也被吸收。后修罗道也出现,联合万象天引,卡卡西的雷分身被破。此时卡卡西已经了解到佩恩的部分能力就是“类似于引力和斥力”的东西。二对一的情况绝对不利……秋道父子赶到攻向佩恩,修罗道被之前破掉的雷分身击中,无法逃脱而被“打扁”。卡卡西告知丁次父子,佩恩能力的5秒间隔时间和自己的计划。随后,卡卡西佯装从地底突袭佩恩,佩恩被迫又一次使出神罗天征将卡卡西弹开,在天道走近卡卡西欲攻击他之时,秋道父子出动肉弹战车攻击佩恩,实则是要借佩恩的能力将他们弹开。佩恩以为只是单纯的攻击,却没想到卡卡西在实行地面攻击之前就将铁链布置在了地下。佩恩天道被牢牢地束缚在了中间,卡卡西用雷切准备攻击。可是这时,未被杀死的修罗道却出现在卡卡西的雷切前,这为天道再次使用“神罗天征”争取时间。天道害怕卡卡西还有其他打算,打算和卡卡西保持一定距离,用钉子射向卡在废墟中无法动弹的卡卡西,但被卡卡西用神威转移。修罗道向丁次发射了跟踪导弹,此时卡卡西的查克拉已所剩不多,但是他最后发动了神威将导弹转移到异空间,保护丁次。因为卡卡西说:这是为了拯救木叶的最好方法——将自己好不容易得来的情报交给能离开的人。虚耗过度的卡卡西,想起了琳、带土、第四代火影以及他父亲……纲手通过通灵兽感知到卡卡西的状况后,愤怒的破坏一根柱子……鸣人回到木叶后,因变成仙人模式可以感觉到大家的查克拉,但没有感觉到卡卡西的查克拉。后鸣人成功感化佩恩的本体——长门,长门运用外道·轮回天生之术使全木叶村所有人复活。卡卡西在精神世界中见到父亲后醒来。
纲手在佩恩一战后仍然昏迷,卡卡西被奈良鹿久提名为火影候选人,并受到火之国大名和高层认可,可大名任命宇智波林渊为六代火影。“面具男宇智波斑”再次不请自来,被大和用木遁束缚,卡卡西以雷切威胁“斑”说出目的。“斑”说了一番大道理后以时空间忍术离开。我爱罗推荐宇智波林渊,受到众影认可。五大忍国与“面具男宇智波斑”之间的战争,忍者联军八万忍者集结主要分为五大部队。第三部队是中短距离支援部队,由兼备速度和体力的忍者组成,旗木卡卡西担任队长。卡卡西结束和被药师兜秽土转生复活的忍刀七人众的战斗后,与阿凯在“斑”欲吸收鸣人的一瞬间夹击“斑”,但被“斑”觉并且躲过,成功救出了鸣人。在与“斑”的对战中因不敌“斑”,而与被“斑”控制的尾兽僵持,僵持一段时间后,尾兽集体准备发出尾兽玉攻击卡卡西与阿凯,危急时刻,卡卡西欲使出神威将尾兽玉转移,阿凯却认为尾兽玉过于巨大无法全部转移,欲牺牲自己开八门遁甲的第八门死门来抵挡尾兽玉,最终被鸣人九尾模式所救,“斑”使用九大尾兽的查克拉复活十尾,忍者联军抵达战场,在忍者联军的接连攻击下将十尾暂时控制住,此时卡卡西已经很累,被鸣人传输了九尾的查克拉以后,体力恢复。