董卓被王允成功谋杀以后，百姓欢庆，长安是夜灯火阑珊。宫中王允和诛董团队思考着下一步动作。董卓伏诛，按理说接下来便是夷其后人，灭三族。王允接着提出弄掉董卓的追随者，余者附议。
当时名士蔡邕在家中，突然听到这一消息，惊诧之间，不由得发出叹息。不是为董卓鸣不平，只是感慨世事多舛。结果有人举报蔡邕与董卓有勾结，并说蔡邕对于董卓被诛感到惋惜。
在司徒王允眼里，这是不可原谅的。早在董卓大厦将倾时，整个长安的眼线都是我王允的了。蔡邕如此怀念董贼，令人将其带到大殿之上。正在笑眯眯的与各位百官，地方势力交谈的王允勃然变色斥责他，蔡伯喈，蔡大学士，你身为王臣，国主危难不思反戈，董卓伏诛反倒嗟痛，是什么意思？
蔡邕回答道，我一学士，有何作为，空腹文章，无力也。司徒大人，罪臣知错，可否令我归乡乞老？
王允一听，你仗着你是名士，我就不敢动你，区区贬谪？让你回家？董卓待你如何？“三日之内，周历三台”，先是拜其为侍御史，又转为侍书御史，再迁为尚书。初平二年，拜你为左中郎将，封高阳乡侯。谁人有你如此待遇？我尚书令都不如你啊？来人，下放廷尉，处以死刑。
王允此时内心权欲膨胀，董卓已死，便以为天下尽在掌中。正是“董卓我都能杀，谁人不能杀？”的心理暗示作祟。
狱中，蔡邕心情失落，见到好友马日磾，请求帮助，企望以鲸首之刑，只为续写《汉史》。
于是，马日磾向王允劝说：“蔡邕是旷世逸才，并且熟知两汉的事，应该让他继续修史，以为一代大典。而且蔡邕一向以忠孝著名，而现在他没有犯什么罪名，这样诛杀会令人民失望。”
但王允却辩驳：“当日汉武帝没有杀司马迁，令他写了毁谤的书（史记）并流传后世。现在东汉衰落，四处都有征战，不可以让佞臣在幼主（汉献帝）身边写史书。不但无益于皇帝的圣德，更令我们等人遭到他的非议。”王允留着一个笔杆子，去非议自己的历史，使自己这些人遭遇“不白之冤”，胡写乱写岂不哀哉？于是，既然下狱，不给其退路，必杀之。
马日磾离开后，向人称王允这样杀蔡邕、断绝史书的写作是灭掉国纪、废弃国典，不会在位太久。当时并不乏如蔡邕一般，平白无故因与董卓有所牵连而被冤枉，荒唐入狱者。只是因为蔡邕实在是大汉名士，飞白体的创造人，一代才女蔡文姬的父亲，受到众人推举的大文豪。于是，王允杀害蔡邕才显得那么突出。而王允杀害蔡邕这个名士，也是不合情理的。你杀了蔡邕，落下把柄无数，后人如何评价于你。
由此，可以证明，王允的内心膨胀速度极快，大概是在摆脱背后控制，无人可以否决自己的观念作祟。
事后，王允，黄琬，郑公业，士孙瑞，吕布，李肃等参与此次诛董事件的人齐聚司徒府，这也是他们之间最后一次会见。期间，王允提出董卓灭了，长安城中余党抓了，接着便是外面的驻军，奉先（吕布字奉先）你和子彦（李肃字子彦）率军灭掉牛辅，剩下的四个将领（李傕，郭祀，樊稠，张济）到时候赦免了吧。君荣（士孙瑞字君荣）啊，你去把城中的兵都收到一起保护长安城，至于黄太尉，郑公业两位大人啊，安定内政还是需要靠你们啊。各位和我共进退，多谢了。明日定当论功行赏。
黄琬与郑公业走出司徒府时互相打量，黄琬道，原本一起在商议，现在全成了他王允一人施发命令。郑公业道，人啊，权力变大了，又没了悬在头上的威胁，那么心自然也就变了。士孙瑞道，诛董是王允之功，无我也。他王允这位子坐不长啊。
当初，中郎将牛辅（董卓之婿）奉董卓之命，率一支军驻守陕县。此刻，吕布派出李肃诛杀牛辅，牛辅在交战中虽胜一阵，但大势已去，营中夜有叛逃，牛辅随后被部下所杀，王允以该军解散了之。
第二日，五更时分，众人来朝，小皇帝坐在龙座之上，看着下面一帮喜气洋洋的大臣面容，心里也很高兴，不过看不见董叔叔，哪位逗自己开心，给自己送上珍馐美味的叔叔去哪里了？
在黄琬率大臣在殿中与小皇帝苦苦等待中，穿着华贵衣衫的王允姗姗来迟，身后跟着刚刚剿灭牛辅叛军的穿着一身血衣的吕布。王允脸上无悲无喜，旁边众人又想开口斥责其来晚之人，均被旁人按住。原来王允是董卓的朝中代言人，如今王允自己当了老大，更惹不起了。
王允在经过一番对于诛董事件的慷慨陈词过后，开始论功行赏。首先是给自己录尚书事，然后以吕布为奋武将军、假节（某方面代替皇权），礼仪如同三公（太傅、司徒、司空），封温侯，与王允共执朝政。而李肃在征讨牛辅时兵败被吕布所杀。而士孙瑞在此之前，则是请求不予其功，盖是王允之功。
于是乎，尚书王允，温侯吕布一个掌政，一个掌军，分配合理，王允总管朝廷大权。王允刚愎自用，做事全凭个人思想，对于吕布，只当做一个可任意驱使的军官。大汉朝廷就完全落入了王允一个人手中。
王允在大肆抓捕朝廷董卓余党时，长安城外面董卓的四个部将李傕、郭祀、樊稠、张济上书请求赦免其等罪过。对于董卓统领的凉州军，一开始打算赦免的王允，大改念头，改了主意，“此辈无罪，从其主耳。今若名为恶逆而特赦之，适足使其自疑，非所以安之之道也。”故此，未予实施不了了之。
结果便是权利欲望膨胀的王允，选择了干掉这四人。既然王允不给李傕他们活路，那么也休想安稳下去。然而王允还没有应对之法，准备细软逃亡凉州的李傕四将此时却在贾诩的授意下整理军团，开始了复董行动，为董卓董相国不白之死、不陈之冤报仇雪恨，长安危矣。
于是乎，执政仅仅二月的尚书事王允正中了马日磾“废纪灭典，其能长久。”之语，继洛阳一把火后，长安又将陷入一场浩劫之中。